《校园迷糊大王三学期》延续了前作的校园喜剧风格，围绕矢野玄一郎、播磨拳儿等一群学生展开。矢野依旧迷糊，常做出令人啼笑皆非的事，她对感情懵懵懂懂，在与不同男生的相处中状况不断。播磨拳儿则继续着自己对爱理的暗恋，为了接近爱理，他想尽办法，却总是弄巧成拙。 在学校里，他们经历了各种有趣的事件。比如文化祭上，大家齐心协力准备表演，过程中状况百出，从道具制作到排练，每个人都贡献着自己的“迷糊”。还有运动会，各班级之间竞争激烈，选手们状况不断，有的在跑步时摔倒，有的在接力中掉棒，却也让整个校园充满了欢乐。 此外，角色们之间的情感线也更加丰富。矢野和其他同学的关系逐渐变化，播磨在追求爱理的道路上有了新的进展和阻碍。这部作品以幽默诙谐的方式展现了校园生活的点点滴滴，充满了青春的活力与欢笑。