《神秘博士第十二季》中，博士依旧带着她的同伴雅姿、瑞安和格雷厄姆开启新的时空冒险。本季开篇，神秘组织“莲花”的出现带来了诸多谜团，他们似乎知晓博士的许多秘密。在第一集里，博士等人来到 2020 年的地球，遭遇了外星生物的袭击，这些生物能控制人类。随着剧情推进，博士发现这一系列事件背后有着更深层次的阴谋。 之后他们前往不同的星球和时空，遇到了各种奇异的生物和文明。在某一集中，他们来到一个被冰雪覆盖的星球，这里的居民正遭受着神秘力量的威胁。博士凭借智慧和勇气解开谜题，拯救了星球。 本季还揭示了博士过去的一些秘密，她与“时间领主”之间的关系也更加复杂。同时，同伴们在冒险中不断成长，与博士的感情也愈发深厚。最终，博士能否解开所有谜团，守护好宇宙的和平，成为本季的一大看点。