《飞天小女警2016第二季》延续了第一季的精彩，三位超能力小女警花花、泡泡和毛毛继续守护小镇村。在这一季中，她们面临着更多元且强大的敌人。比如邪恶的莫乔乔乔，它不断想出新的阴谋诡计来破坏小镇的和平，时而制造出巨大的机械怪兽在城市中横冲直撞，时而操纵高科技装置引发各种混乱。还有怪博士，他研发出各种危险的生化武器，企图用这些武器控制小镇。 小女警们在应对这些敌人的过程中，也有不少有趣的故事。泡泡天真可爱，偶尔会因为心软而放走一些小反派，但也因此让大家看到了她善良的一面。花花聪明冷静，总是能在关键时刻想出应对策略。毛毛则勇敢无畏，在战斗中冲在最前面。她们凭借各自的能力和团队协作，一次次化解危机，保护着小镇居民的安全，继续书写着属于她们的英雄传奇。